阿莫西林克拉維酸鉀和頭孢是兩種藥物，可以分別治療不同的病原菌感染，所以無法單純判斷二者哪個效果好。對于革蘭陽性菌以及厭氧菌，阿莫西林克拉維酸鉀的抗菌效果較好，而頭孢種類較多，針對的病原菌也比較廣。
阿莫西林克拉維酸鉀屬于青霉素類抗生素，而頭孢屬于頭孢菌素類抗生素，上述兩類藥物都歸屬為β-內酰胺類抗生素，作用機制有一定的相似性，但是抗菌譜、抗菌作用的強度等各方面又有一定的差異。因此，對不同病菌感染，上述抗生素有著各自的優勢與劣勢，只有結合具體的病原菌用藥才比較正確，而不能一概而論哪個效果好。而頭孢種類繁多，其中一代和二代頭孢偏向于革蘭陽性球菌感染，而三代頭孢、四代頭孢偏向于革蘭陰性桿菌感染，所以建議遵醫囑選用更為合適的藥物。
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