清胃黃連丸建議在飯后服用，主要考慮因素有減少胃腸道刺激、提高藥物吸收率、避免空腹不適、藥效持久性、飲食影響。
1、減少刺激：
清胃黃連丸含有黃連等苦寒成分，可能對胃黏膜產生刺激。飯后胃內存在食物緩沖，可降低藥物直接接觸胃壁的風險，減輕惡心、胃痛等不適感。尤其對于慢性胃炎或胃潰瘍患者，飯后服藥更為安全。
2、吸收優化：
食物能延緩胃排空速度，使藥物在消化道停留時間延長。清胃黃連丸中的黃芩苷、梔子苷等有效成分可隨食糜緩慢釋放，提高小腸吸收效率。脂溶性成分在進食后膽汁分泌增加的環境下吸收更充分。
3、空腹禁忌：
部分人群空腹服用可能出現心慌、反酸等反應。糖尿病患者合并胃輕癱時，空腹服藥可能加重胃部不適。藥典記載黃連大苦大寒，脾胃虛寒者尤其需避免空腹用藥。
4、藥效維持：
飯后服藥能使藥物作用時間與消化周期同步。清胃黃連丸常用于胃火熾盛引起的口瘡、牙齦腫痛，餐后血藥濃度高峰與進食后胃酸分泌高峰期重疊，可更好發揮清熱解毒功效。
5、飲食協同：
服用期間應避免辛辣油膩食物，以防加重胃火。服藥后1小時內不宜飲茶，以免鞣酸影響黃連生物堿吸收。可配合清淡飲食如小米粥、山藥等養護胃氣。
清胃黃連丸作為清熱劑，適用于胃熱證候，典型表現為牙齦腫痛、口舌生瘡、煩渴等。服藥期間需觀察大便性狀，出現腹瀉應減量。慢性病患者需中醫師辨證調整用藥方案，不可自行長期服用。孕婦及陽虛體質者慎用，兒童用藥需遵醫囑。存儲時注意防潮，保持藥丸干燥完整。
