蜂膠口腔膜不宜與抗凝血藥物、免疫抑制劑及部分中藥合用。蜂膠中的活性成分可能通過藥物相互作用影響療效或增加不良反應風險，合并用藥需在醫生指導下調整。
抗凝血藥物如華法林、阿司匹林與蜂膠合用時需謹慎。蜂膠可能增強抗凝效果，增加出血風險。臨床表現為牙齦出血、皮下瘀斑等癥狀時，應立即就醫監測凝血功能。
免疫抑制劑如環孢素、他克莫司與蜂膠存在潛在相互作用。蜂膠的免疫調節作用可能干擾藥物療效，導致移植排斥或自身免疫疾病復發。用藥期間出現發熱、移植部位疼痛等異常需及時復查血藥濃度。
含鞣質的中藥如五倍子、地榆與蜂膠同用可能影響吸收。鞣質與蜂膠中的黃酮類成分結合后形成沉淀，降低雙方生物利用度。建議間隔2小時以上服用，避免同時間段使用。
蜂膠口腔膜與局部麻醉劑如利多卡因凝膠存在配伍禁忌。蜂膠可能延緩黏膜修復，與麻醉劑合用時易引發局部灼痛或過敏反應。口腔治療前24小時應停用蜂膠制劑。
特殊人群用藥需加強監測。糖尿病患者合用蜂膠與降糖藥可能出現低血糖，肝腎功能不全者代謝異常可能加劇藥物蓄積。聯合用藥期間建議定期檢測血糖及肝腎功能指標。
