調經種子丸不宜與抗凝藥物、激素類藥物、抗生素、免疫抑制劑及含相反成分的中成藥聯用。具體藥物包括華法林、阿司匹林、雌激素制劑、四環素類抗生素、環孢素等。
1、抗凝藥物：調經種子丸含活血化瘀成分，與華法林、阿司匹林等抗凝藥聯用可能增加出血風險。兩類藥物均通過影響凝血機制發揮作用，疊加效應易導致皮下瘀斑、鼻衄等癥狀。用藥期間需監測凝血酶原時間。
2、激素類藥物：雌激素制劑如炔雌醇可能干擾中藥調節內分泌的作用。調經種子丸通過補腎調經改善卵巢功能，外源性激素會打亂體內激素平衡，降低種子丸療效并誘發乳房脹痛等副作用。
3、抗生素：四環素類抗生素如多西環素會與中藥金屬離子形成螯合物。種子丸所含牡蠣等礦物藥可能降低抗生素生物利用度，同時影響中藥有效成分吸收，導致雙重藥效減弱。
4、免疫抑制劑：環孢素等藥物與種子丸聯用可能加重肝腎負擔。中藥代謝產物需經肝臟轉化，免疫抑制劑同樣通過肝酶代謝，兩者競爭排泄途徑易致藥物蓄積，引發轉氨酶升高或腎功能異常。
5、相反中成藥：含大黃、芒硝的瀉下類中成藥與種子丸存在配伍禁忌。種子丸以溫補為主，峻下攻伐類藥物會抵消其滋補效果，可能引起腹痛腹瀉等不良反應，需間隔4小時以上服用。
服用調經種子丸期間需保持飲食清淡，避免辛辣刺激食物影響藥效吸收。建議配合八段錦、太極拳等舒緩運動調節氣血運行，用藥后出現皮膚瘙癢或月經量異常增多應立即停藥就診。慢性病患者聯合用藥前應提供完整用藥清單供醫師評估，中藥與西藥服用時間至少間隔2小時。
