肝囊腫通常無須藥物治療，若出現感染或壓迫癥狀可遵醫囑使用頭孢克肟分散片、阿莫西林膠囊、左氧氟沙星片等抗生素，或考慮超聲引導下穿刺硬化治療。肝囊腫多為先天性或退行性病變，藥物無法消除囊腫，主要治療方法有定期觀察、穿刺引流、腹腔鏡手術。
1、抗生素治療
合并細菌感染時需使用抗生素，頭孢克肟分散片對肝膽系統感染常見病原菌敏感，適用于輕度感染；阿莫西林膠囊作為廣譜青霉素類藥物，可覆蓋多數革蘭氏陽性菌；左氧氟沙星片對肝膽系統混合感染效果顯著。使用前需確認無過敏史，療程根據感染程度調整。
2、穿刺硬化治療
適用于直徑超過5厘米且有壓迫癥狀的單純性囊腫，在局部麻醉下將無水乙醇注入囊腔，使囊壁上皮細胞失活。該操作需由超聲科或介入科醫師完成，術后可能出現短暫腹痛或低熱，需監測肝功能變化。禁忌癥包括凝血功能障礙或囊腫與膽管相通者。
3、腹腔鏡手術
多發性囊腫或位置特殊的囊腫可選擇腹腔鏡下囊腫開窗術，通過腹壁小切口切除部分囊壁，使囊液流入腹腔被吸收。相比開腹手術創傷更小，恢復更快，但需評估患者心肺功能。術后可能出現胸腔積液等并發癥，需住院觀察。
4、中醫輔助調理
柴胡疏肝散可緩解肝區脹悶感，主要成分為柴胡、白芍等，具有疏肝理氣功效；鱉甲煎丸對減緩囊腫增長可能有一定作用，含鱉甲、丹參等活血化瘀成分。中藥治療需辨證施治，不可替代西醫規范處理，服用期間需定期復查囊腫變化。
5、營養支持
維生素E軟膠囊可能幫助減輕氧化應激對肝細胞的損傷，輔酶片可促進蛋白質消化吸收。合并肝功能異常者可適量補充復方甘草酸苷片，但需注意這些藥物僅作為輔助手段，不能縮小現有囊腫體積，過量補充可能增加代謝負擔。
肝囊腫患者日常需避免劇烈運動導致囊腫破裂，每6-12個月復查超聲監測變化。飲食以低脂高蛋白為主，限制動物內臟攝入，禁酒及辛辣刺激食物。若出現持續右上腹疼痛、黃疸或發熱需立即就診，警惕囊腫出血、感染或癌變等并發癥。保持規律作息與情緒穩定有助于肝膽系統功能維護。
